Kraj jako vyšší územní samosprávný celek ČR vznikl v roce 2000. Byl zřízen jako Jihlavský kraj, následně 31. května 2001, získal nový název Vysočina, což bylo iniciováno předchozí anketou mezi občany kraje a usnesením zastupitelstva kraje. Kraj ale 2. srpna 2010 navrhl ústavní zákon, jímž se má název změnit na Kraj Vysočina, Poslanecká sněmovna 23. března 2011 tento návrh ve znění komplexního pozměňovacího návrhu reagujícího na stanovisko vlády schválila. Tato novela ústavního zákona nakonec úspěšně prošla celým legislativním procesem a nabyla účinnosti dne 1. srpna 2011. Od tohoto data jde tedy již o „Kraj Vysočina“. Druhou změnu názvu předkladatel zdůvodnil tím, že si ji vynutila sama praxe, protože subjekty používají název Vysočina ve spojení s určením kraj naprosto běžně, a to i v písemných a právních dokumentech, a prosté označení Vysočina bez dalšího vymezení komplikuje namnoze určení, zda se nejedná například o obchodní organizaci nebo výrobek, eventuálně geografický pojem.